Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CtifQ6PEE2 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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