Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Q3U6N9 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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