Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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