Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pkp1P97350 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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