Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RxraP28700 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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