Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms