Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smim18J3QNP2 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms