Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms