Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Gm20830J3KML6 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Gm20830J3KML6 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Gm20830J3KML6 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Gm20830J3KML6 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm20830J3KML6 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.6 ms