Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms