Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms