Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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H2-M5A7VMS3 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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