Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Nrf1Q9WU00 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms