Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms