Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc47Q9D024 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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