Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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