Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pabpn1Q8CCS6 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms