Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Snx17Q8BVL3 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms