Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms