Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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