Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms