Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim71Q1PSW8 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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