Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ttc39dQ0VF76 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms