Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms