Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VhlP40338 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VhlP40338 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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