Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Pou3f1P21952 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms