Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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H2-Eb1P04230 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Eb1P04230 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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