Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Rpl21-ps3-201ENSMUST00000080223 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm13360-201ENSMUST00000121607 799 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm13997-201ENSMUST00000155641 336 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 1700019D03Rik-204ENSMUST00000186266 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Scgb1b12-201ENSMUST00000188355 417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 4933404K13Rik-203ENSMUST00000217125 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC153974.1-201ENSMUST00000219012 430 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 4930404H11Rik-202ENSMUST00000222756 1271 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm28038F7BCN9 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms