Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms