Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Usp29Q9ES63 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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