Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc97Q9DBT3 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms