Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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