Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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