Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms