Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Nup88Q8CEC0 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Nup88Q8CEC0 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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