Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
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