Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Atg9aQ68FE2 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms