Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Yipf3Q3UDR8 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms