Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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VgfQ0VGU4 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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VgfQ0VGU4 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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VgfQ0VGU4 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
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VgfQ0VGU4 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
VgfQ0VGU4 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
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