Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfaP20033 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms