Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms