Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn34c3J3QJW5 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms