Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rrn3B2RS91 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms