Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Spocd1B1ASB6 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms