Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CtcflA2APF3 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms