Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rnft1Q9DCN7 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms