Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms