Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Use1Q9CQ56 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms