Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pacsin3Q99JB8 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms