Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms